Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms