Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC23.77■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms