Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms