Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms