Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMF1P82094 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMF1P82094 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMF1P82094 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMF1P82094 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMF1P82094 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMF1P82094 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMF1P82094 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMF1P82094 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMF1P82094 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMF1P82094 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMF1P82094 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMF1P82094 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMF1P82094 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMF1P82094 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMF1P82094 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMF1P82094 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMF1P82094 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMF1P82094 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMF1P82094 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMF1P82094 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMF1P82094 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMF1P82094 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMF1P82094 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMF1P82094 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMF1P82094 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMF1P82094 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMF1P82094 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMF1P82094 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMF1P82094 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMF1P82094 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMF1P82094 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMF1P82094 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMF1P82094 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMF1P82094 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMF1P82094 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMF1P82094 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMF1P82094 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMF1P82094 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMF1P82094 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMF1P82094 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMF1P82094 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMF1P82094 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMF1P82094 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMF1P82094 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMF1P82094 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMF1P82094 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMF1P82094 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMF1P82094 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMF1P82094 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMF1P82094 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMF1P82094 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMF1P82094 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMF1P82094 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMF1P82094 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMF1P82094 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMF1P82094 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMF1P82094 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMF1P82094 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMF1P82094 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMF1P82094 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMF1P82094 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMF1P82094 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMF1P82094 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMF1P82094 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMF1P82094 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms