Protein–RNA interactions for Protein: P61962

DCAF7, DDB1- and CUL4-associated factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF7P61962 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms