Protein–RNA interactions for Protein: P58511

SMIM11A, Small integral membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM11AP58511 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms