Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms