Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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PGGT1BP53609 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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PGGT1BP53609 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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PGGT1BP53609 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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PGGT1BP53609 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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PGGT1BP53609 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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PGGT1BP53609 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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