Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVDP53602 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms