Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms