Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms