Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms