Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA4P35212 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA4P35212 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms