Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTX2P32243 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OTX2P32243 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTX2P32243 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTX2P32243 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTX2P32243 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTX2P32243 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTX2P32243 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTX2P32243 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTX2P32243 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTX2P32243 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTX2P32243 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTX2P32243 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTX2P32243 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTX2P32243 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTX2P32243 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTX2P32243 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTX2P32243 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTX2P32243 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTX2P32243 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTX2P32243 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTX2P32243 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTX2P32243 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTX2P32243 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTX2P32243 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTX2P32243 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTX2P32243 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTX2P32243 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
OTX2P32243 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
OTX2P32243 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
OTX2P32243 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTX2P32243 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTX2P32243 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
OTX2P32243 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTX2P32243 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTX2P32243 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTX2P32243 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTX2P32243 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTX2P32243 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms