Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms