Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms