Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms