Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms