Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2A2P16615 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2A2P16615 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2A2P16615 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2A2P16615 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2A2P16615 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2A2P16615 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2A2P16615 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2A2P16615 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2A2P16615 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2A2P16615 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2A2P16615 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2A2P16615 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2A2P16615 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2A2P16615 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2A2P16615 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2A2P16615 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2A2P16615 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms