Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB1P16220 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB1P16220 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms