Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2P10911 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2P10911 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms