Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLA1P09884 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLA1P09884 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLA1P09884 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLA1P09884 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLA1P09884 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLA1P09884 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLA1P09884 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLA1P09884 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLA1P09884 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLA1P09884 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLA1P09884 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLA1P09884 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLA1P09884 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
POLA1P09884 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLA1P09884 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
POLA1P09884 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLA1P09884 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
POLA1P09884 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLA1P09884 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLA1P09884 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
POLA1P09884 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLA1P09884 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLA1P09884 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
POLA1P09884 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLA1P09884 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLA1P09884 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLA1P09884 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLA1P09884 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLA1P09884 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
POLA1P09884 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLA1P09884 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLA1P09884 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLA1P09884 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLA1P09884 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLA1P09884 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLA1P09884 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
POLA1P09884 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
POLA1P09884 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLA1P09884 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
POLA1P09884 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLA1P09884 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLA1P09884 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLA1P09884 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLA1P09884 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLA1P09884 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLA1P09884 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLA1P09884 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLA1P09884 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLA1P09884 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLA1P09884 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLA1P09884 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLA1P09884 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLA1P09884 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLA1P09884 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLA1P09884 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLA1P09884 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLA1P09884 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLA1P09884 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLA1P09884 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLA1P09884 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLA1P09884 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLA1P09884 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLA1P09884 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLA1P09884 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLA1P09884 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLA1P09884 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLA1P09884 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLA1P09884 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLA1P09884 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLA1P09884 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLA1P09884 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms