Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms