Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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