Protein–RNA interactions for Protein: O00585

CCL21, C-C motif chemokine 21, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL21O00585 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL21O00585 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL21O00585 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL21O00585 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL21O00585 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CCL21O00585 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL21O00585 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL21O00585 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL21O00585 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL21O00585 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL21O00585 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL21O00585 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL21O00585 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL21O00585 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL21O00585 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL21O00585 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL21O00585 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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