Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms