Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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