Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms