Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GGTLC3B5MD39 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms