Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC162PA2VCL2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms