Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms