Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms