Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H6

KCNE3, Potassium voltage-gated channel subfamily E member 3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNE3Q9Y6H6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNE3Q9Y6H6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNE3Q9Y6H6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNE3Q9Y6H6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNE3Q9Y6H6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNE3Q9Y6H6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNE3Q9Y6H6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNE3Q9Y6H6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNE3Q9Y6H6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNE3Q9Y6H6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNE3Q9Y6H6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNE3Q9Y6H6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNE3Q9Y6H6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNE3Q9Y6H6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNE3Q9Y6H6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNE3Q9Y6H6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNE3Q9Y6H6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNE3Q9Y6H6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNE3Q9Y6H6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNE3Q9Y6H6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNE3Q9Y6H6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNE3Q9Y6H6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNE3Q9Y6H6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNE3Q9Y6H6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNE3Q9Y6H6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNE3Q9Y6H6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms