Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDY1Q9Y6F8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms