Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PARP3Q9Y6F1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PARP3Q9Y6F1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
PARP3Q9Y6F1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PARP3Q9Y6F1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PARP3Q9Y6F1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PARP3Q9Y6F1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PARP3Q9Y6F1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PARP3Q9Y6F1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PARP3Q9Y6F1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PARP3Q9Y6F1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PARP3Q9Y6F1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PARP3Q9Y6F1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PARP3Q9Y6F1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
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