Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUBP2Q9Y5Y2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms