Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF18Q9Y5U5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF18Q9Y5U5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF18Q9Y5U5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF18Q9Y5U5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF18Q9Y5U5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF18Q9Y5U5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF18Q9Y5U5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF18Q9Y5U5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF18Q9Y5U5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF18Q9Y5U5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF18Q9Y5U5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF18Q9Y5U5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF18Q9Y5U5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF18Q9Y5U5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF18Q9Y5U5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TNFRSF18Q9Y5U5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFRSF18Q9Y5U5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF18Q9Y5U5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF18Q9Y5U5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF18Q9Y5U5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF18Q9Y5U5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF18Q9Y5U5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF18Q9Y5U5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF18Q9Y5U5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF18Q9Y5U5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF18Q9Y5U5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms