Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTDP1Q9Y5B0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.53■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CTDP1Q9Y5B0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms