Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y572

RIPK3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK3Q9Y572 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RIPK3Q9Y572 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIPK3Q9Y572 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIPK3Q9Y572 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIPK3Q9Y572 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIPK3Q9Y572 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIPK3Q9Y572 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIPK3Q9Y572 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RIPK3Q9Y572 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIPK3Q9Y572 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIPK3Q9Y572 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms