Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms