Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDGFL3Q9Y3E1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms