Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMED5Q9Y3A6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMED5Q9Y3A6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms