Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT52Q9Y366 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms