Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP3M1Q9Y2T2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3M1Q9Y2T2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms