Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2F5

ICE1, Little elongation complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE1Q9Y2F5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ICE1Q9Y2F5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ICE1Q9Y2F5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ICE1Q9Y2F5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ICE1Q9Y2F5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ICE1Q9Y2F5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ICE1Q9Y2F5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ICE1Q9Y2F5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ICE1Q9Y2F5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ICE1Q9Y2F5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ICE1Q9Y2F5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ICE1Q9Y2F5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ICE1Q9Y2F5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ICE1Q9Y2F5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ICE1Q9Y2F5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ICE1Q9Y2F5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ICE1Q9Y2F5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ICE1Q9Y2F5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ICE1Q9Y2F5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms