Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMG5Q9UPR3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms