Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PADI4Q9UM07 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms