Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM00

TMCO1, Calcium load-activated calcium channel, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO1Q9UM00 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMCO1Q9UM00 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCO1Q9UM00 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms