Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITGA11Q9UKX5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGA11Q9UKX5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms